Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms