Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ms4a6dQ99N07 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms