Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TirapQ99JY1 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms