Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms