Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms