Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms