Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OptnQ8K3K8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms