Protein–RNA interactions for Protein: Q794H2

Nap1l3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nap1l3Q794H2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nap1l3Q794H2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nap1l3Q794H2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms