Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms