Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kiaa1549Q68FD9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms