Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

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Length 821 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Capn3Q64691 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Capn3Q64691 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capn3Q64691 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms