Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms