Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms