Protein–RNA interactions for Protein: Q60864

Stip1, Stress-induced-phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stip1Q60864 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stip1Q60864 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms