Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms