Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chpf2Q3UU43 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms