Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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