Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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