Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms