Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms