Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms