Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chl1P70232 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms