Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp46P62069 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms