Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn18P56857 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn18P56857 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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