Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dbx1P52950 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms