Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms