Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms