Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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