Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Saa4P31532 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms