Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifnb1P01575 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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