Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sp1O89090 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sp1O89090 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sp1O89090 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sp1O89090 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sp1O89090 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sp1O89090 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sp1O89090 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms