Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Timm44O35857 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms