Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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