Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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