Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3415J3QMS8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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