Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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