Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc146E9Q9F7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms