Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms