Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Btbd35f28A2CFD5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms