Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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