Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Itgb4A2A863 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Itgb4A2A863 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itgb4A2A863 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itgb4A2A863 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itgb4A2A863 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itgb4A2A863 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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