Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms