Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms