Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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