Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg3Q9JL95 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms