Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms