Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms