Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms