Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Nop56Q9D6Z1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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