Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms